MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015850	GA	3	6	143973	143978	50 %	0 %	50 %	0 %	340780882
3002	NC_015850	CG	3	6	144033	144038	0 %	0 %	50 %	50 %	340780882
3003	NC_015850	TGGT	2	8	144050	144057	0 %	50 %	50 %	0 %	340780882
3004	NC_015850	GAT	2	6	144100	144105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780882
3005	NC_015850	AG	3	6	144115	144120	50 %	0 %	50 %	0 %	340780882
3006	NC_015850	GT	3	6	144159	144164	0 %	50 %	50 %	0 %	340780882
3007	NC_015850	TGG	2	6	144192	144197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780882
3008	NC_015850	GCCA	2	8	144242	144249	25 %	0 %	25 %	50 %	340780882
3009	NC_015850	CAA	2	6	144306	144311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340780882
3010	NC_015850	GGT	2	6	144373	144378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780882
3011	NC_015850	GGC	2	6	144403	144408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780882
3012	NC_015850	GGCA	2	8	144465	144472	25 %	0 %	50 %	25 %	340780882
3013	NC_015850	AT	3	6	144474	144479	50 %	50 %	0 %	0 %	340780882
3014	NC_015850	CGGT	2	8	144486	144493	0 %	25 %	50 %	25 %	340780882
3015	NC_015850	CGA	2	6	144505	144510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780882
3016	NC_015850	GGC	2	6	144520	144525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780882
3017	NC_015850	TTG	2	6	144570	144575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340780882
3018	NC_015850	AG	3	6	144649	144654	50 %	0 %	50 %	0 %	340780882
3019	NC_015850	GTG	2	6	144663	144668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780882
3020	NC_015850	TCG	2	6	144804	144809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780882
3021	NC_015850	GTC	2	6	144836	144841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780882
3022	NC_015850	CAT	2	6	144853	144858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780882
3023	NC_015850	GCC	3	9	144944	144952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780882
3024	NC_015850	GAC	2	6	144974	144979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780882
3025	NC_015850	GCT	2	6	145133	145138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780882
3026	NC_015850	TGG	2	6	145155	145160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780882
3027	NC_015850	TGA	2	6	145218	145223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780882
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3029	NC_015850	ACG	2	6	145257	145262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780882
3030	NC_015850	ATC	2	6	145280	145285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340780882
3031	NC_015850	GCT	2	6	145289	145294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780882
3032	NC_015850	GGC	2	6	145366	145371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780882
3033	NC_015850	ATT	2	6	145391	145396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340780882
3034	NC_015850	GGC	2	6	145490	145495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780882
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3037	NC_015850	CAGCC	2	10	146015	146024	20 %	0 %	20 %	60 %	340780883
3038	NC_015850	ACC	2	6	146052	146057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340780883
3039	NC_015850	GGT	2	6	146087	146092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780883
3040	NC_015850	AT	3	6	146127	146132	50 %	50 %	0 %	0 %	340780883
3041	NC_015850	AG	3	6	146151	146156	50 %	0 %	50 %	0 %	340780883
3042	NC_015850	GTAA	2	8	146158	146165	50 %	25 %	25 %	0 %	340780883
3043	NC_015850	CGG	2	6	146197	146202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_015850	TAA	2	6	146235	146240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_015850	CTTT	2	8	146259	146266	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3046	NC_015850	TAT	2	6	146295	146300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_015850	TTATT	2	10	146301	146310	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_015850	TGG	2	6	146349	146354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_015850	TTC	2	6	146390	146395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_015850	AGCA	2	8	146616	146623	50 %	0 %	25 %	25 %	340780884
3051	NC_015850	CAAG	2	8	146800	146807	50 %	0 %	25 %	25 %	340780884
3052	NC_015850	TGT	2	6	146896	146901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340780884
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3055	NC_015850	ACCTG	2	10	147022	147031	20 %	20 %	20 %	40 %	340780884
3056	NC_015850	GCA	2	6	147043	147048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780884
3057	NC_015850	GCA	2	6	147094	147099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780884
3058	NC_015850	CGA	2	6	147140	147145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780884
3059	NC_015850	TTC	2	6	147456	147461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340780884
3060	NC_015850	CGT	2	6	147490	147495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780884
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3062	NC_015850	TGG	2	6	147594	147599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_015850	AAG	2	6	147693	147698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340780885
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3065	NC_015850	CGA	2	6	147887	147892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_015850	CACGT	2	10	147972	147981	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3067	NC_015850	TCA	2	6	148000	148005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_015850	AGC	2	6	148014	148019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_015850	GCG	2	6	148083	148088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780886
3070	NC_015850	GGT	2	6	148190	148195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780886
3071	NC_015850	GCAG	2	8	148220	148227	25 %	0 %	50 %	25 %	340780886
3072	NC_015850	CTG	3	9	148284	148292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780886
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3083	NC_015850	GTTTG	2	10	148901	148910	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_015850	GCT	2	6	148911	148916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3085	NC_015850	CGG	2	6	148919	148924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3086	NC_015850	GC	3	6	148999	149004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3087	NC_015850	GC	3	6	149050	149055	0 %	0 %	50 %	50 %	340780887
3088	NC_015850	GTC	2	6	149172	149177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_015850	GAG	2	6	149213	149218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_015850	GCTTT	2	10	149247	149256	0 %	60 %	20 %	20 %	340780888
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3093	NC_015850	ACC	2	6	149592	149597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340780888
3094	NC_015850	TCG	2	6	149599	149604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780888
3095	NC_015850	TCC	2	6	149639	149644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340780888
3096	NC_015850	CTG	2	6	149684	149689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3097	NC_015850	CCT	2	6	149768	149773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3098	NC_015850	GCG	2	6	149918	149923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_015850	CGGTG	2	10	149927	149936	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3100	NC_015850	TCTGC	2	10	150011	150020	0 %	40 %	20 %	40 %	340780889
3101	NC_015850	CG	3	6	150055	150060	0 %	0 %	50 %	50 %	340780889
3102	NC_015850	GAG	2	6	150100	150105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_015850	TCC	2	6	150134	150139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3104	NC_015850	AT	3	6	150190	150195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_015850	GCG	2	6	150231	150236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3106	NC_015850	GAT	2	6	150258	150263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_015850	ACC	2	6	150266	150271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3108	NC_015850	GGCA	2	8	150273	150280	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3109	NC_015850	CCG	2	6	150438	150443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780890
3110	NC_015850	ACC	3	9	150455	150463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340780890
3111	NC_015850	TGG	2	6	150478	150483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780890
3112	NC_015850	TATC	2	8	150500	150507	25 %	50 %	0 %	25 %	340780890
3113	NC_015850	GCA	2	6	150526	150531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780890
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3120	NC_015850	GGA	2	6	150842	150847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340780890
3121	NC_015850	GCG	2	6	150970	150975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780890
3122	NC_015850	GCG	2	6	151046	151051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780890
3123	NC_015850	CCCA	2	8	151075	151082	25 %	0 %	0 %	75 %	340780890
3124	NC_015850	GGT	2	6	151118	151123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780890
3125	NC_015850	CCA	2	6	151188	151193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340780890
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3230	NC_015850	GGGTT	2	10	156699	156708	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
3231	NC_015850	ACTG	2	8	156716	156723	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3232	NC_015850	TGT	2	6	156804	156809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3233	NC_015850	CAA	2	6	157043	157048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3234	NC_015850	GTG	2	6	157100	157105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3235	NC_015850	AAAT	2	8	157117	157124	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3236	NC_015850	ATG	2	6	157188	157193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3238	NC_015850	GAC	2	6	157319	157324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780897
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3240	NC_015850	TTA	2	6	157352	157357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3241	NC_015850	A	6	6	157370	157375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3242	NC_015850	TTTGG	2	10	157387	157396	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3243	NC_015850	TAT	2	6	157429	157434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3244	NC_015850	CTA	3	9	157451	157459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3246	NC_015850	TG	3	6	157491	157496	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3247	NC_015850	GAA	2	6	157516	157521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3248	NC_015850	TTC	2	6	157863	157868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3249	NC_015850	TCTT	2	8	157893	157900	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3251	NC_015850	TAT	2	6	157920	157925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3253	NC_015850	TGA	2	6	157991	157996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3255	NC_015850	GTT	2	6	158074	158079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340780898
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3488	NC_015850	GCCC	2	8	171362	171369	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3489	NC_015850	CAC	3	9	171385	171393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3491	NC_015850	GCT	2	6	171529	171534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3497	NC_015850	TC	3	6	171817	171822	0 %	50 %	0 %	50 %	340780913
3498	NC_015850	G	6	6	171912	171917	0 %	0 %	100 %	0 %	340780913
3499	NC_015850	CGG	2	6	171945	171950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780913
3500	NC_015850	GGC	2	6	172181	172186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780914

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